Unos extraños pulsos electromagnéticos sacuden Japón el 16 de marzo de 1999,provocando fallas eléctricas y confundiendo a todo el país. Pronto,se darían cuenta de que nunca fueron una especie dominante. Criaturas sobrenaturales despertarían repentinamente en el país del sol naciente,y pocos sabían lo que sucedía. El nuevo milenio estaba cerca,y con él,la antigua profecía japonesa del fin del mundo también se acercaba. Su poder aumenta por cada vez que es derrotado. Es un ser inmortal,una criatura que solo busca destrucción y caos para alimentar su retorcida mente. Cada milenio,esa cosa reencarna,volviéndose más fuerte por cada reencarnación. Ese horror del abismo cósmico es llamado por muchos nombres. "La Deidad del Abismo,el Horror Cósmico,el Dios Encarnado". Pero el nombre que nuestros hermanos japoneses le han dado es: Gojira.