Just Go! menceritakan kehidupan seorang pelajar yang bernama Endou Hayashida yang merupakan siswa SMA Kokuen yang terkenal dengan siswa berandalannya. Endou Hayashida awalnya adalah anak yang hanya fokus pada sekolahnya dan tidak memerdulikan pertarungan, namun lambat laun ia dipaksa untuk ikut bertarung karena perselisihan abadi antara SMA Kouken dan SMA Fukahi. Kemampuan bertarung luar biasa yang dimiliki Endou perlahan mulai terlihat, yang mengakibatkan dirinya perlahan menuju puncak berandalan terkuat di wilayah kota Fuketsu.