Mystic Pop-up Bar menceritakan sebuah kafe misterius yang terletak di atap gedung bernama Ssanggab Cart Bar dan pemiliknya adalah Wol Joo (Hwang Jung Eum). Kafe ini buka setiap malam dan pelanggannya adalah orang yang normal dan juga orang yang sudah meninggal dunia. Kafe ini menyediakan berbagai jenis makanan, serta menjadi tempat untuk pelanggannya bercerita dan juga menyembuhkan luka dalam hati mereka.