L'histoire se déroule en 1923 au Japon. Les vampires sont chassés par le gouvernement pour protéger les citoyens. Mais une mystérieuse source de sang artificielle appelée "Ascra", fait croître le nombre de vampire. Pour les contrer, le gouvernement a créé l'unité "Code Zero" utilisant des vampires pour pouvoir enquêter sur l'Ascra et tuer les vampires nuisant à la société.
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