Finita la guerra con gli alieni, le ragazze Mew Mew hanno riacquistato i loro poteri proprio mentre degli strani eventi fanno presagire l'avvento di una nuova minaccia. Le cinque paladine avranno a che fare con qualcosa superiore alle possibilità di un normale essere umano, con il destino della Terra ancora una volta nelle loro mani le Mew Mew scopriranno che esiste qualcuno forse in grado di aiutarle a prevenire l'imminente catastrofe.
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