Trata de Jonathan un joven entrenador, que no estaba muy enterado de la situación de su región (kanto),descubre al equipo oscuridad,experimenta su poder, con la ayuda de Lon el hijo de un comandante oscuridad, podrán atravesar la región ganando el odio del equipo oscuridad. Jonathan descubre que el equipo oscuridad controla la liga y la region
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