Suite à l'entrainement de Ray et Nate pour aider Nate à perfectionner ses pouvoirs grâce au sérum modifié de Ray, ces derniers tombent du Waverider et arrive au Japon féodal où le Shogun vole l'armure de Ray. Malheureusement, le seul moyen pour ne pas créer une aberration temporelle et laisser le Shogun déclenchait une guerre c'est de détruire l'armure de Ray. Nate doit détruire l'armure de Ray. Ces derniers sont récupérés par l'équipe, Ray ne quitte plus sa chambre et Nate s'en veut.