Em algum passado distante, era um Shinigami, não um Shinigami qualquer, mas possivelmente um poderoso Capitão, já que ele deixou a entender que é um (ele também usa a roupa de um capitão, porém, sem o símbolo), talvez grande amigo de Urahara Kisuke, existe alguma ligação não esclarecida entre os dois, Urahara Kisuke até mesmo demonstra um respeito anormal com ele, o chamando de senhor como se no passado Isshin Kurosaki fosse seu superior ou algo desse nível, porém, capitão não chama outro capitão Shinigami de senhor, a ligação entre os dois ainda é um misterio. Saiu da Soul Society para viver uma vida como humano, se casando e tendo filhos, escondendo seu poder durante 20 anos. Virou um médico, abrindo uma enfermaria. Cuida de seus três filhos.
Uma noite, Kurosaki Ichigo foi fazer um trabalho de Shinigami na cidade e deixou Kon em seu corpo, se aproveitando da oportunidade, Kon resolveu sair para aprontar, porém, Grand Fisher (Hollow que matou a mãe de Ichigo) veio atrás dele para enfrenta-lo, já que agora ele estava diferente, estava sem sua mascara Hollow, virara um Arrancar. Após uma perseguição, Fisher derruba Kon e aplica o golpe final que é interrompido por um amuleto que Isshin Kurosaki fez para protejer Kon no corpo de Ichigo. Após alguns momentos, Isshin aparece em sua forma de shinigami!
Grand Fisher começa a zombar de Isshin Kurosaki, principalmente pelo tamanho de sua Zanpakutou, Isshin Kurosaki então o ensina a regra basica dos Shinigamis, todos com um nível igual ou superior a de um capitão, controla o tamanho de suas Zanpakutou, se não eles lutariam com uma espada do tamanho de um prédio (indireta ao tamanho da espada do Grand Fisher). Com apenas um golpe e sem demonstrar esforço algum, ele corta Grand Fisher no meio e o chama de moleque, dizendo que ele tinha que aprender essa regra basica antes de querer conversar sobre Shinigamis, em seguida Grand Fisher cai atrás dele.
Ele revela à Kon que ele sabia de tudo sobre ele e Ichigo há muito tempo, desde da primeira vez que kon entrou em seu corpo, motivo esse dele nunca o chama de Ichigo quando este estava em seu corpo. Ele fez o amuleto (que Ichigo acha ridiculo) para proteger Kon. Ao conversar com Urahara Kisuke ele demonstra um vasto conhecimento sobre o mundo espiritual, tanto que já sabia que os Vaizards iriam atrás de seu filho um dia.
Ele revela também que esta se preparando para uma guerra assim como os Vaizards e os Arrancars e nota que os dois lados estão recrutando aliados: Vaizards recrutando Shinigamis com poderes de Hollow e Arrancars recrutando Hollow com poderes de Shinigamis. Ele revela também saber de muitas coisas que estão rolando até mesmo as intenções de Aizen Sousuke.
Quando é para ser serio, ele é uma pessoa coerente que não se deixa levar por suas emoções, nem mesmo mantinha raiva do Hollow que matou sua mulher, ao contrário, tinha raiva dele mesmo por não ser capaz de chegar a tempo de evitar isso.
